[Shay Ben Moshe]

אני לא בטוח שזה מה שאתה מחפש, אבל זה עושה שאם הבקשה היא לקובץ או לתיקייה קיימים זה לא מעביר:

RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.*)$ index.php?/$1 [L]

אם זה לא מה שחיפשת זה יעשה את העבודה:

RewriteCond $1 !^admin
RewriteRule ^(.*)$ index.php?/$1 [L]